血精症的病因很多，男性生殖系、下尿路及全身性疾病都可能发生血精 ，可引起血精的器官包括前列腺、精囊、射精管、输精管、膀胱、尿道、附睾及睾丸。
血精症最常见的病因是精囊炎。
最多见的病因，青年血精患者大多数的病因是炎症与感染，以精囊炎最多见。多为炎症反应，没有细菌感染。而感染多数为非特异性细菌感染，但淋球菌、结核分支杆菌、病毒、衣原体及支原体感染都可以引起血精。
有些良性肿瘤及增殖性病变，如精囊囊腺瘤、后尿道腺瘤（又可称为前列腺息肉）、增殖性尿道炎、后尿道黏膜异位前列腺组织等都可发生血精。
男性生殖系器官的恶性肿瘤可发生血精，其中以前列腺及精囊的恶性肿瘤为多见。
前列腺及精囊的动静脉畸形和血管瘤可引起血精。后尿道及膀胱颈部的黏膜静脉曲张，既可发生血尿，也可导致血精。
全身性疾病并发血精者包括高血压精囊淀粉样变性、恶性淋巴瘤、坏血病等。血友病及严重肝病也可发生血精。
如会阴部或盆腔损伤，睾丸损伤等。
常见的病因有前列腺活检，前列腺注射，输精管结扎后，睾丸切除后，肛痔硬化剂治疗后，高强度频率超声，前列腺冷冻疗法后等。一般可以从患者的病史中获得线索。某些药物如阿司匹林、华法林及抗血栓药物的应用，也可能诱发血精。
