儿童的干燥综合征须与慢性复发性腮腺炎、传染性腮腺炎和肿瘤相鉴别。但这些疾病不存在口和眼干燥、皮疹、关节症状和抗核抗体检查为阴性。

　　病毒性腮腺炎通常称之为流行性腮腺炎，较多发生于幼儿或少年时期有传染接触史，可双侧或单侧受累，白细胞不但不增高反而减低或正常，局部症状和化脓性差不多，但没有化脓倾向。

　　涎腺肿瘤 干燥综合症(舍格林综合征)有的局部有包块，又无任何其他症状，涎腺造影为肿瘤样所见，术前不易与涎腺肿瘤区别。如临床上伴又某些症状，如眼干、口干及其他结缔组织病;且侵犯不止一个腺体，其他涎腺也又肿大现象;或造影时同时伴有末梢导管扩张或副腺体又末梢导管扩张，排空功能迟缓等，均又助于鉴别。

　　小儿糖尿病：常表现为多尿、多饮、多食及体重减轻的症状称三多一少。发病诱因常由于感染、饮食不当等发病。：二病均可有口干症状，但糖尿病多饮、多尿、多食和消瘦更明显，血糖增高，而无干燥综合征的眼、口腔及实验室异常。

　　家族性周期性麻痹：二者均可有低钾而致麻痹，补钾后可好转，但该病常无干燥综合征的其他症状和实验室异常。