沙眼衣原体多数情况下感染眼、鼻咽部、子宫颈、尿道及直肠黏膜等部位。沙眼衣原体在孕妇可累及子宫颈的柱状上皮细胞，很少累及阴道鳞状上皮细胞，还可逆行感染子宫内膜，损伤胚胎，可造成死产、早产、胎膜早破等。新生儿在通过感染衣原体的母亲产道时，可感染衣原体引起结膜炎和肺炎。

　　1.结膜炎

　　受感染的新生儿，约30% ～ 50% 会患结膜炎。

　　症状：

　　● 大约于出生后5 ～ 14 天发病，有的可在出生后2 天左右发病。

　　● 通常先从一只眼睛开始，眼睛里有黏性分泌物，翻看眼睑能看到充血肿胀。

　　2.肺炎

　　受感染的新生儿，约10% ～ 20% 会发生肺炎。

　　症状：

　　大约于出生后1 ～ 3 个月发病，表现为咳嗽、鼻塞、气促，有时伴发热症状。

　　3.鼻咽部感染

　　衣原体侵入肺部是经由鼻泪管到鼻咽部，继而到肺的，因此鼻咽部也会有不同程度的感染。

　　症状： 表现为咳嗽、鼻塞，有时宝宝会因为咽喉疼痛而哭闹。

　　4.其他 其他部位的感染，如阴道、直肠的感染症状，多隐匿而不易察觉。

　　根据病史、临床表现及实验室检查做出诊断。实验室诊断可取鼻咽部、气管抽吸液及肺活检标本作衣原体培养、抗原检测和PCR检测。如实验室检查条件有限，可根据可疑临床表现，结合胸片、血嗜酸性粒细胞计数、血清IgG、IgM检查;必要时做细菌培养以排除其他感染，即可做出本病的诊断。