尤文肉瘤最常见的临床表现为局部疼痛或肿块以及肿块所引起的压迫症状。另外，根据病变部位、大小、周围器官的侵袭情况以及远处转移的情况，其症状会有所不同。
尤文肉瘤最常发生在骨盆（髋骨）、胸壁（如肋骨或肩胛骨）和腿，但也可能发生于身体的其它部位。
80%患有尤文肉瘤的儿童和青少年，都会感到肿瘤区域的疼痛和肿胀，这种疼痛可能是间歇性的，有时会发生在夜间，并且会随着时间的推移而恶化。骨痛可能是由于肿瘤扩散到了骨外层（骨膜）之下，也可能是由于骨头被肿瘤侵蚀，而发生了骨折。
随着病情的发展，大多数骨尤文肉瘤和几乎所有非骨骼（软组织）尤文肉瘤都会引起肿块或肿胀，这种肿块或肿胀在手臂或腿部的肿瘤中更容易发现。对于胸壁或骨盆中的肿瘤，由于难以触摸到，因此较难引起注意。
大约20%~25％的尤文肉瘤患者，在确诊时就已经出现转移，转移部位多见于肺、骨、骨髓以及颅内。
如果肿瘤转移到脊柱附近，会引起背痛以及手臂或腿部无力，麻木或麻痹，甚至产生脊髓压迫的症状（如尿、便潴留或失禁）。转移到肺部的肿瘤，会导致呼吸急促。出现骨髓侵袭的患儿，临床上可表现为发热、贫血、出血、感染等血细胞异常而出现的症状。若肿瘤转移至颅内，由于占位效应，可能会引起颅高压症状，主要表现为头痛、恶心、喷射状呕吐等。
另外，由于肿瘤压迫症状颅内神经，可能导致神经系统症状，主要表现为运动障碍、感觉障碍、癫痫发作等。总的来说，根据病变部位、大小、周围器官的侵袭情况以及远处转移的情况的不同，会出现不同的症状。
10%~20%的患者就诊时，存在全身症状，比如发热、乏力、食欲低下、体重减轻或贫血等。
