不同类型包茎的病因有所差异，生理性包茎为先天发育所致，病理性包茎多继发于其他疾病。
原发性包茎又称生理性包茎，是一种正常的生理现象，因胎儿在发育过程中包皮内板与阴茎头的相互融合状态导致。但出生后在雄激素作用、上皮细胞角化、阴茎生长发育、包皮垢堆积以及阴茎间断性的勃起等因素的作用下，包茎可逐渐消失。
继发性包茎又称病理性包茎，一般由于局部炎症、感染、创伤等因素导致包皮口瘢痕挛缩、狭窄、皮肤弹性丧失等原因导致，一般无法自行消失或自愈。
阴茎头包皮炎、局部感染、创伤、糖尿病、肥胖、干燥性闭塞性龟头炎，长期反复导尿等介入性操作和阴茎及直肠等邻近部位的放疗，以及局部卫生保持不佳、外界环境湿热等，都是继发性包茎常见诱发因素。
