血常规注意嗜酸粒细胞计数，小红细胞低血红蛋白性贫血。大便常规找虫卵或饱和盐水飘浮法找虫卵确诊，必要时作虫卵计数。直肠镜检或脱垂的直肠上查见鞭虫成虫亦可确诊。
检查方法有：生理盐水直接涂片法；饱和盐水浮聚法；水洗自然沉淀法。为主确定感染程度可应用定量板-甘油玻璃计数法（加腾改良法）。乙状结肠镜或纤维结肠镜检查时可见到虫体附着于肠粘膜上，虫体旁可见粘液。粘膜轻度充血且易出轿。借助肠镜检查亦可作为鉴别诊断的手段，以便排除其他肠道疾病。X线钡剂灌肠检查，运用气钡双重造影法可以发现涂有钡剂的透光虫体外形。
