鼻前庭囊肿无明确的致病原因，目前有面裂学说和腺体潴留学说两种类型，一般更多的认为是面裂因素所致鼻前庭囊肿，且本病无诱发因素。
鼻前庭囊肿的发病原因目前有两种学说，即面裂学说和腺体潴留学说，且以前者为主导。
属于先天性发育异常，即在胚胎发育期，在上颌突、内侧鼻突的球状突、外侧鼻突等各面突融合部位，由于发育异常而形成的胚性上皮残余，逐渐形成面裂囊肿，属于胚胎性裂隙囊肿。
即鼻前庭底部黏膜的黏液腺管口出现阻塞，导致分泌物潴留，从而形成囊肿。
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