疣体夹除术是治疗传染性软疣最有效的方法之一，也可采用药物、冷冻、激光、电灼和手术切除等方法治疗。
是治疗本病的有效方法。医生会先给皮肤进行常规消毒，然后用镊子将软疣夹破，挤出其内容物最后外涂碘酊等以防细菌感染。
外科切除手术也可考虑，但可能会形成瘢痕。
应注意保持创面的干燥、清洁，1周内禁止浸泡、沐浴。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
精确地涂抹于皮损处，可加速皮损消退。水杨酸联合聚维酮碘溶液治疗疗效比单独使用水杨酸更好。
可用于免疫功能不全或免疫抑制的患者，5%咪喹莫特霜剂可有效清除疣体。
局部外用刺激炎症反应，疗效满意。
是一种抗病毒药物，制剂有1%~3%的软膏或霜剂。
液态苯酚（石炭酸）或10%~20%的苯酚溶液，精确地涂于皮损部位也有一定的疗效。
如维A酸软膏、5%氢氧化钾溶液、硝酸银软膏、0.3%~0.5%鬼臼毒素霜、冰醋酸及30%三氯醋酸溶液等。合并细菌感染时可先外用莫匹罗星软膏。
是一种抗病毒药物，静脉滴注，适用于皮损广泛、常规治疗无效或免疫功能不全、免疫抑制患者。
曾认为西咪替丁具有免疫调节作用，可促进传染性软疣的皮损消退，但现在临床已不常用。
用冷冻器将液氮喷于疣体表面，需要间隔3~4周重复进行。适用于承受疼痛能力较低的患者，尤其是低龄患者。
医生会先进行常规消毒，将疣体周围皮肤绷紧。然后用特制的工具置于皮损边缘，工具与皮肤呈一定的角度，轻轻加压并迅速刮除软疣内乳酪状小体。之后用2.5%碘酒消毒液外涂并止血，消毒3次/天。该疗法疼痛感较为适中，见效快，相比其他疗法效果显著，适合患者群体较广。
适用于较大的疣体损害。
常规消毒后，医生会用高频电灼治疗仪针状电极刺入软疣体中央脐窝凹陷处，深度约为1~2mm，对软疣体逐个进行点刺烧灼。一般1个软疣体烧灼1次即可，较大软疣体可分2~3次点刺烧灼。完成后会用碘酒或者氯化钠注射液进行消毒处理。该方法疗效显著，但是相对来说较疼。
激光治疗也可去除疣体，但是可能会形成瘢痕。直到感染消除。
