1.较小的溃疡需与轻型复发性口疮相鉴别，创伤性溃疡有明显的局部损伤因素，溃疡大小不一，与刺激物相一致，无复发性、自限性。而复发性口疮无明显局部因素，圆形或椭圆形，直径2～4mm，有复发性和自限性。
2.较大的溃疡需与腺周口疮、结核性溃疡、癌肿相鉴别（见表）。
口腔粘膜大溃疡的鉴别诊断
| 重型口疮 | 结核性溃疡 | 创伤性溃疡 | 癌肿溃疡 | |
| 年龄 | 年轻人多 | 中年人多 | 不限 | 老年 |
| 部位 | 任何部位 | 任何部位 | 任何部位 | 任何部位 |
| 口腔后部多见 | 舌多见 | 刺激因素附近 | ||
| 溃疡特点 | 大而深 | 边缘不整齐有潜凹 | 不定形 | 菜花状 |
| 弹坑状 | 底部肉芽呈颗粒状 | 与刺激因素吻合 | ||
| 基部柔软或轻度浸润 | 时间久有组织增生 | 基部浸润广且硬 | ||
| 复发性 | 有 | 无 | 无 | 无 |
| 自限性 | 有 | 无 | 无 | 无 |
| 全身情况 | 常较好 | 常有肺结核 | 良好 | 弱或恶病质 |
| 活检 | 慢性炎症 | 结核结节（有郎罕巨细胞等） | 慢性炎症 | 癌变组织 |
