治疗以药物驱虫，以及止痛、利胆、控制感染等措施为主。梗阻严重者或出现胆道、胰腺并发症，还需进行手术。
胆道蛔虫病并发化脓性胆管炎、坏死性胰腺炎等需要尽早手术。可行胆总管切开探查、T形管引流。
一般治疗主要包括对症治疗、营养支持治疗。
患者应卧床休息，予以解痉止痛、利胆对症治疗，症状缓解之后再进行驱虫治疗。同时纠正水电解质紊乱、控制继发细菌感染、营养支持。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
药物治疗具体包括解痉止痛、利胆驱虫、控制感染等。
口服33%硫酸镁及解痉药可缓解疼痛，剧痛时可注射抗胆碱药如阿托品、山莨菪碱（654-2）等，必要时可加用哌替啶。
酸性环境不利于蛔虫活动，发作时可使用食醋、酸梅汤使成虫静止，从而减轻刺激；症状缓解后再选用驱虫剂，常用驱虫剂有阿苯达唑、甲苯达唑、左旋咪唑等。
可选用对肠道细菌及厌氧菌敏感的抗生素，预防和控制感染，如头孢类、喹诺酮类抗生素。
经非手术积极治疗未能缓解，或者合并胆管结石、或有急性重症胆管炎、肝脓肿、重症胰腺炎等合并症者，可行胆总管切开探查、T形管引流术。术中可应用胆道镜检查，取出虫体，引流胆道。术后仍需服用药物驱虫治疗，防止胆道蛔虫复发。该手术无明显并发症。
