对于合并马蹄肾的腹主动脉瘤患者，应在尽量保护肾组织的基础上切除腹主动脉瘤，行人工血管移植术。
手术是该病治疗的主要方法。采用自剑突至耻骨联合的腹部正中切口，与通常腹主动脉瘤一样，可在马蹄肾峡部以上安全游离瘤颈部，注意勿损伤双侧肾盂部，牵拉马蹄肾可充分显露主动脉分叉部和髂总动脉，如峡部为纤维性结构可切断以利显露，腹主动脉瘤近、远端阻断后切开腹主动脉瘤。在腹主动脉瘤瘤壁内行主动脉与人工血管的吻合，如有发自腹主动脉瘤的异常肾动脉，应吻于开窗的人工血管上对靠近主动脉分叉部的异常肾小动脉分支亦应充分保护，必要时重建，最后用瘤外壁包裹人工血管。术中注意应避免切断含肾实质的峡部，因为切断峡部常致出血、肾梗死和可能存在的感染尿液渗漏，引起人工血管的致命感染。术后应用抗生素预防感染，监测和改善肾脏功能。
