黄斑囊样水肿的治疗，一般均应治疗原发疾病，眼内炎症引起的应给以抗炎药物，如视网膜血管炎、葡萄膜炎，可给大剂量的肾上腺皮质激素。近年来曲安奈德作为一种长效的糖皮质激素越来越多地应用于眼科临床治疗中，以玻璃体腔给药的方式治疗黄斑囊性水肿。非特异性的黄斑囊样水肿，例如：视网膜中央或分支静脉阻塞、糖尿病性视网膜病变、视网膜毛细血管扩张症等，如果眼底荧光素血管造影证实有视网膜毛细血管的渗漏，而且病程已经超过3个月以上，视力和病变没有自行好转的迹象，也可以考虑应用激光作黄斑区格子样光凝。黄斑区格子样光凝最好采用黄色激光，如无黄色激光，也可使用绿色激光，最好不用蓝色激光。因为黄斑区视网膜神经纤维层中含有大量叶黄醇，它可吸收蓝色光，可损害视网膜神经纤维，从而引起视功能受损。绿色光少量被吸收，黄色光则不吸收，因此黄色光对黄斑区最安全。

对于视网膜中央、分支静脉阻塞、糖尿病性视网膜病变等疾病进行全视网膜光凝(PRP)时，最好先行黄斑区格子样光凝，1周后再行PRP，否则容易加重黄斑囊样水肿。

少数非特异性、非炎性黄斑囊样水肿，不宜使用糖皮质激素，也不适宜使用激光治疗，例如Irvine-Gass综合征、特发性黄斑囊样水肿，可给乙酰唑胺及吲哚美辛药物口服。应用乙酰唑胺治疗黄斑囊样水肿有较好的疗效，乙酰唑胺以及其他碳酸酐酶抑制药可以减轻各种原因引起的黄斑水肿。

吲哚美辛作为前列腺素抑制药，可以作为预防黄斑囊样水肿的药物，减少血管性的黄斑囊样水肿的发生。

近年来认为玻璃体的牵引可能是糖尿病性黄斑囊样水肿产生或加重的原因之一。有人比较了玻璃体后脱离与糖尿病性视网膜病变黄斑囊样水肿的关系，有玻璃体后脱离的病人55%没有发生黄斑囊样水肿，仅20%伴有黄斑囊样水肿。玻璃体后脱离者少发生黄斑囊样水肿，提示玻璃体后脱离可能起到了防止黄斑发生水肿的作用。因此玻璃体切除并分离玻璃体后皮质，可能对黄斑囊样水肿有一定的疗效。国内外已在临床上使用玻璃体切除治疗糖尿病黄斑水肿术，但其疗效尚有待更长期的观察。