对于没有症状的良性结节，建议定期复诊观察，防止出现癌变；
对于有症状的甲状腺结节，如果结节体积大到造成患者呼吸或者吞咽困难，需要手术切除治疗。
此外，任何的治疗方式都不是孤立存在的，医生会结合患者的具体情况，确定最适合患者病情的个性化治疗方案，并观察随访。
甲状腺结节不存在急性期。如果结节较大，患者出现了吞咽困难和呼吸困难，需要及时寻求医生的帮助。
随访观察。由医生定期对患者进行体格检查和甲状腺功能检查。如果良性结节的大小一直没有变化，通常不用治疗干预。
甲状腺激素抑制疗法。本疗法的目的是控制患者的促甲状腺激素（TSH）水平，防止良性结节进一步增长。
手术。对于体积较大的甲状腺结节，同时造成了患者吞咽困难、呼吸困难的，考虑通过手术切除。
对于那些会分泌甲状腺激素的结节，医生会针对患者异常的激素水平进行治疗，主要包括以下三种方案：
放射性碘。放射性碘会被甲状腺结节吸收，使结节缩小。
抗甲状腺药物。患者需要长期服用抗甲状腺药物，来调整自身的激素水平。但部分药物带有很强的肝肾毒性，长期服用会对肝脏和肾脏功能造成不良影响，患者一定要严格依照医生处方进行治疗。
手术。如果前两者方式无法有效控制病情，考虑手术切除这些甲状腺结节，如果病情严重，考虑切除部分甲状腺。
恶性结节的常规治疗方式是切除。切除的部位不仅包括结节，还包括周围部分甲状腺组织，甚至是大部分或全部甲状腺。
手术存在损伤喉部神经的潜在风险，术前医生会充分告知患者风险可能性。术后，部分患者需要终身服用左旋甲状腺素来维持机体甲状腺激素处于正常水平。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
如果结节引起甲状腺功能亢进，一般情况下可以用放射性碘治疗，复方碘口服液(Lugol液)等，或者服用抗甲状腺药物来抑制甲状腺激素的分泌。目前常用的抗甲状腺药物是硫脲类化合物，包括硫氧嘧啶类的丙基硫氧嘧啶(PTU)和甲基硫氧嘧啶(MTU)及咪唑类的甲硫咪唑和卡比马唑。
手术治疗后，部分患者可能需长期服用左旋甲状腺素，以此维持机体甲状腺水平正常。
本手术需切除全部甲状腺，能达到彻底切除病灶的目的。同时，术中有损伤喉部神经和甲状腺周围组织风险。
术后患者易发生甲状腺功能低下，要长期服用药物进行替代治疗。
本手术是针对性切除了病变组织，保留了一侧腺体正常腺体组织，损伤较小，患者术后恢复较快，相关并发症也比较少。对于部分早期的恶性病变及大部分良性病变适用。
是近几年兴起的一种新型治疗良性甲状腺结节疾病手术方法，是一种微创手术，主要适用于良性结节的缩小和消除，不建议恶性结节患者采用。
是一种利用腔镜进行手术治疗的方法。由于手术切口可设在口腔前庭、胸前、腋窝、锁骨下方等隐蔽部位，可被衣服遮挡且手术切口较小，具有良好的美容效果。但不适用于较大的结节切除，也不建议晚期恶性患者采用。
该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物可缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
暂未有文献表明甲状腺结节可以自愈。大多数甲状腺结节不会有症状，如果结节体积较小，不会对患者生活造成影响。如果是体积较大的良性结节，需要医生进行治疗干预。如果是恶性结节，通常建议及时切除，患者不要寄希望于自行好转，以免进展为晚期甲状腺癌，甚至发生癌细胞扩散，危及生命。
