女性有尿路感染症状应考虑是否存在阴道炎、生殖器溃疡或淋病。通过妇科检查可以明确，如果患者存在阴道分泌物或外阴炎症常可鉴别，盆腔双合诊可以鉴别盆腔肿块和盆腔炎。
有尿急、尿频、尿痛等下尿路症状并存在脓尿，但尿培养阴性的患者应考虑有无淋病双球菌感染或解脲支原体感染。对一般抗菌药物治疗无效的尿路感染应检查有无泌尿系统结核。
对有下尿路症状但没有感染证据的女性患者，应与引起下尿路症状的其他疾病如膀胱过度活动症等相鉴别。
青年男性需与前列腺炎引起的下尿路症状相鉴别，中老年男性需与前列腺增生等疾病引起的下尿路症状相鉴别。
缺乏充分感染依据的膀胱刺激征患者应排除有无膀胱原位癌的存在，可行膀胱镜检查并多点活检以防漏诊。?
