治疗包括抗病毒治疗、对症治疗及全身治疗。抗病毒治疗使其疗效明显提高，并大大降低其死亡率和并发症发生率。阿昔洛韦(无环鸟苷)是治疗单纯疱疹脑炎的首选药，其特点是对正常细胞无毒，选择性抑制单纯疱疹病毒特殊的DNA聚合酶，治疗愈早，可防止病毒复制造成的细胞损害。所以临床只要考虑单纯疱疹病毒脑炎，就应马上应用阿昔洛韦(无环鸟苷)，10mg/kg，1次/8h，每次需滴注1h，应维持10天，以后改为口服维持。除此外还应积极支持对症治疗，退热、降低颅内压、控制癫痫发作，维持水盐电解质平衡。
脑炎的中医治疗也应辨证施治，急性期，卫气同病者应辛凉解表，清气泄热；邪在气分则清气解毒，泄热生津；气营两燔则应气营两清，泄热醒热。
