Constantin von Economo先后收集和观察了上千例von Economo脑炎的病例，并对此进行了仔细的研究，将von Economo脑炎的临床表现分为3种临床综合征，即：嗜睡性眼肌麻痹综合征(somnolent-ophthalmoplegic syndrome)，运动功能亢进综合征(hyperkinetic syndrome)和肌张力障碍运动失调综合征(myodystonia-akinetic syndrome)。临床上首先出现的是嗜睡表现，有些患者在工作和进餐时表现为昏昏欲睡的样子，有些患者表现为行为异常。
这些异常的行为有时会误诊为精神异常，所以在尚未出现典型临床表现和确诊之前，患者往往看精神科医生。除此以外，患者也会被误诊为癫痫和癔症。
1.嗜睡性眼肌麻痹综合征 发热、头昏、嗜睡、昏睡、神志恍惚、昏迷、抽搐、癫痫。肢体或脑神经麻痹，常见有双侧眼肌麻痹引起的眼球运动障碍，其他脑神经受累时还可以出现复视、斜视、眼睑下垂、瞳孔扩大或缩小等。
2.运动功能亢进综合征 面部肌肉僵硬，表情淡漠，兴奋躁动，阵挛或舞蹈症，肌张力障碍，手足徐动。
3.肌张力障碍运动失调综合征 全身肌肉僵硬、乏力、倦怠、软弱无力、震颤、肌张力障碍、共济失调、行走困难。
大多数患者在急性期因为严重并发症而死亡，仅极少数患者能够存活下来，但留有严重的帕金森综合征、吞咽困难、复视等后遗症。
主要根据临床表现，如嗜睡、不自主运动、动眼神经麻痹和帕金森综合征等，结合流行病学资料及实验室检查做出诊断。
