医生接诊后将根据患者的临床表现和体格检查初步怀疑，此时较易与阑尾炎相混淆，将结合影像学检查和腹腔镜探查结果诊断为盲肠炎。
本病与急性阑尾炎、克罗恩病有相似之处，医生将从多个方面进行检查后综合判断。
急性阑尾炎的症状与盲肠炎的症状高度相似，都可能会出现右下腹疼痛、恶心呕吐、发热等症状，在影像学检查中，二者由于位置相近，也常常容易漏诊误诊。急性阑尾炎的腹痛特点为转移性右下腹疼痛，当实验室检查和影像学检查难于鉴别二者时，可通过腹腔镜区别二者。
克罗恩病是多见于末段回肠及相邻结肠的炎性肉芽肿性疾病，其与盲肠炎的相似之处为右下腹疼痛，体格检查时有明显压痛，以及腹泻、血便、发热等症状。但克罗恩病患者可以肛周病变为首发症状，且随病情发展，患者有体重下降、贫血、瘘管形成等表现，可通过内镜检查和影像学检查区分二者。
