手术是膀胱肿瘤的主要治疗手段，对于恶性肿瘤，需采用化疗、免疫治疗、光动力治疗等综合治疗。
主要采用经尿道膀胱肿瘤电切术（表浅非肌层浸润膀胱尿路上皮癌）或根治性膀胱全切术（肌层浸润膀胱癌）。
膀胱良性肿瘤及部分恶性肿瘤，不适合经尿道切除且不具备根治性膀胱切除手术条件时，亦可选择膀胱部分切除术达到切除肿瘤的目的。如术前有证据或怀疑为膀胱副神经节瘤时，应充分扩容并做好术前准备，避免术中切除肿瘤时出现剧烈的血压波动。
对于非肌层浸润膀胱癌患者，采用术后灌注化疗进行治疗。常用药物有吡柔比星、表柔比星等。对于转移性膀胱癌可行全身化疗。
对于非肌层浸润高级别尿路上皮癌的预防复发可选择卡介苗膀胱灌注治疗。对转移性膀胱癌可选择新型免疫疗法。
光动力疗法是采用静脉或局部给光敏剂，使之光敏剂在肿瘤局部浓聚，通过特定波长光照，产生光化学反应，而杀灭肿瘤。此法对卡介苗治疗失败的膀胱癌患者仍有一定疗效。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
由于膀胱肿瘤患者灌注化疗后并发尿道感染的比率较高，且主要致病菌以大肠埃希菌和鲍氏不动杆菌为主，应根据病情行抗菌治疗。
