医生会评估患者体格发育及营养状况，包括身高、体重和体脂分布特征，乳房发育及甲状腺情况；观察皮肤有无改变，如全身毛发增多、痤疮等。
医生会依次观察外阴发育、阴毛分布、阴蒂大小、阴道和宫颈情况；检查有无异常排液和分泌物，子宫位置、大小、质地和活动度，双侧输卵管和卵巢有无增厚、包块和压痛，子宫直肠陷凹有无触痛性结节，下腹有无压痛、反跳痛和异常包块。
对诊断有无排卵具有很重要的意义。
在下次月经前5～9天检测孕酮水平估计有无排卵，同时在月经周期第2～4天测定卵泡刺激素（FSH）、促黄体生成素（LH）、雌二醇（E2）、睾酮（T）和催乳素（PRL）的基础水平，了解无排卵的原因。
根据羊齿植物状结晶的出现与否判断有无排卵，如果月经前仍可见到羊齿状结晶表示无排卵。该方法目前已经较少应用。
有性生活的女性推荐使用经阴道超声，可以观察子宫和卵巢的大小、位置、形态、有无异常结节或包块。同时还可监测卵泡发育和子宫内膜的情况。
可以观察输卵管通畅的情况，应该在月经干净后3～7天、且没有任何禁忌证时检查再做。
宫腔镜、腹腔镜检查：用于体格检查、超声检查和（或）子宫输卵管造影提示存在异常的患者，可明确病变的位置和严重程度，并可同时进行相应的治疗。
