须与外源性过敏性肺泡炎相鉴别的有病毒性肺炎，粟粒性肺结核，结节病，特发性肺纤维化，支气管哮喘。外源性过敏性肺泡炎与支气管哮喘的鉴别见后表1。
表1 外源性过敏性肺泡炎与支气管哮喘的鉴别
| 外源性过敏性肺泡炎 | 外源性支气管哮喘 | |
| 特异质 | 大多无 | 大多有 |
| 组织学改变 | 肺泡和间质腔淋巴细胞浸润 | 支气管壁水肿和嗜酸粒细胞浸润 |
| 病变部位 | 肺泡和间质腔 | 支气管 |
| 发病 | 接触抗原后4～6小时发作 | 接触抗原后迅速发病 |
| 全身症状 | 有发热、畏寒乏力等 | 几乎无 |
| 体征 | 细湿罗音 | 哮鸣音 |
| X线表现 | 急性期呈细结节状阴影或正常 | 肺脏充气过度或正常 |
| 肺功能改变 | 限制性通气障碍，弥散功能减退 | 阻塞性通气障碍 |
| 血清学检查 | 沉淀抗体阳性IgE正常 | IgE升高、沉淀抗体阴性 |
| 主要变态反应类型 | ⅢⅣ型 | Ⅰ型 |
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