性心理障碍是生物-心理-社会因素综合作用的结果。
目前仍不能证明生物学原因的存在。有学者认为遗传或体质上的细微因素有可能会影响本病的发生，如胎儿的雄激素水平会影响到成年后大脑对性生活的控制能力，如果该发育过程受到干扰，可能导致个体性生理和性心理发育更容易受到环境的有害影响而出现性心理障碍，但该假设也尚未得到更多的研究结果支持。
心理因素可能在该病的病因学中占主导地位，该病与文化背景也有一定关系：
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