小儿发热的原因有很多，通常包括感染因素和非感染因素，另外一些环境因素也能导致该症状。感染因素一般为病毒、细菌、真菌、支原体等，非感染因素包括风湿疾病、肿瘤、药物中毒等。
为临床常见的发热机制，包括感染、恶性肿瘤（如白血病、淋巴瘤等）、创伤、手术、免疫性疾病、梗死、肺栓塞等。
包括惊厥、甲状腺功能亢进等。
包括广泛性皮炎、烧伤、外胚层发育不良致汗腺缺乏、中暑、新生儿衣被过厚致捂热综合征等。
见于下丘脑体温中枢受累，如大脑发育不全，脑性瘫痪，颅脑损伤、出血，高钠血症，新生儿脱水热，安眠药中毒，暑热症等。
多数由感染引起，如中耳炎、喉炎、咽炎、鼻窦炎、扁桃体炎等。
3岁以下婴幼儿以感染性疾病、先天性疾病、恶性肿瘤为主要病因。3岁以上儿童，以感染、风湿性疾病、恶性肿瘤、下丘脑体温中枢受累、散热障碍等为主要病因。
以结核病、扁桃体炎等感染性疾病，甲状腺功能亢进、尿崩症等非感染性疾病为主要病因。
服用某些药物中毒时可出现小儿发热，如水杨酸、阿托品、安眠药等。
新生儿出生后生存环境会发生很大的变化，首先是环境温度有明显的下降，加之体表面积大，散热多，而且体温调节的能力又差，容易出现低体温。
温差变化大时，不注意增减衣物导致受凉，或日常生活中运动量过大容易出汗等都可能导致小儿发热。
