目前，只要及早诊断，术前仔细分型，细心手术加上术前和术后的化疗，则预后大为改观。近年来，5年治愈率有明显提高。即使有肺部单一结节的转移，如能切除，5年生存率仍可大于40%。
比较一致的观点是，骨肉瘤一旦经病理证实，就应该立即开始前期的化学治疗。切除肿瘤组织是骨肉瘤治疗中最为重要和迫切的任务。近年来随着肿瘤外科技术的提高和内置物研究的发展，肢体保存疗法显示了较好的治疗前景。
肿瘤组织切除后的巩固性化学治疗对控制肿瘤转移，提高治疗生存率非常重要。一般在手术治疗施行后继续进行，并做好随访工作。
治疗骨肉瘤应行根治手术。有条件的病例可做局部广泛切除而保留肢体。此外，截肢前要做活体组织检查，以进一步证实临床和X线诊断。为了防止肿瘤扩散可用电刀操作。
放疗和化疗均为重要的辅助治疗。放射治疗宜分成几个阶段：①活检前1000～2000Gy共5～6天，最后1天为进行活检的日期。随后在截肢前后给6000～8000rad。②化学治疗包括选用大剂量甲氨蝶呤（MTX）、亚叶酸钙（甲酰四氢叶酸）、多柔比星（阿霉素）、博来霉素（争光霉素）、放线菌素D（更生霉素）作为复合剂应用。
免疫治疗为静脉输入淋巴细胞或用干扰素和转移因子，但效果尚未肯定。
