(一)粪便检查 粪便检查是诊断寄生虫病常用的方法。要取得准确的结果，粪便必须新鲜，送检时间一般不宜超过24小时。如检查肠内原虫滋养体，最好立即检查。盛粪便的容器要干净，并防止污染与干燥;粪便不可混杂尿液等，以免影响检查结果。
(二)血液检查 血液检查是诊断疟疾、丝虫病的基本方法。涂制血膜用的载玻片用前需经洗涤液处理，自来水、蒸馏水冲洗，在95%酒精中浸泡，擦干或烤干后使用。
(三)排泄物与分泌物等的检查
1.痰液 痰中可能查见肺吸虫卵、溶组织内阿米巴滋养体、棘球蚴的原头蚴、粪类圆线虫幼虫、蛔蚴、钩蚴、尘螨等;卡氏肺孢子虫的包囊也可出现于痰中，但检出率很低。
2.十二指肠液和胆汁 用十二指肠引流管抽取十二指肠液及胆汁，以直接涂片法镜检;也可经离心浓集后，吸取沉渣镜检。可检查蓝氏贾第鞭毛虫滋养体、华支睾吸虫卵、肝片形吸血卵和布氏姜片虫卵等;急性阿米巴肝脓肿患者偶在胆汁中发现大滋养体。
3.尿 一般先离心，后取沉渣镜检。但乳糜尿需加等量乙醚，用力振荡，使脂肪溶于乙醚。然后吸去脂肪层
，离心，取沉渣镜检。
4.鞘膜积液 主要检查班氏微丝蚴。阴囊皮肤经碘酒精消毒后，用注射器抽取鞘膜积液作直接涂片检查，也可加适量生理盐水稀释离心，取沉渣镜检。
5.阴道分泌物 检查阴道毛滴虫。
(四)其它器官组织检查。
