克罗恩病是一种慢性、复发率高的、全消化道非特异性炎症，治疗原则是缓解症状，以药物和营养治疗为主。根据本病发作症状的不同，分为轻度、中度、重度。依据不同程度选择不同治疗：
1.内科治疗
(1)支持和对症治疗 给予高热量、高蛋白、低渣饮食，供应足量的维生素D和铁。必要时可输全血、氨基酸、白蛋白等肠道外静脉营养。为了减少疼痛，可给镇静、止痛药，如有细菌感染时，可给适当的抗生素。
(2)免疫疗法 肾上腺皮质激素可缓解症状。常用强的松，分3次服，症状好转改为隔日一次，连续2～4周后缓慢递减剂量，使全身症状好转，以利于病儿生长发育，也可缩短病程。6-巯基嘌呤与小量激素同用，对慢性活动性患者有效。水杨酸偶氮磺胺吡啶可用以治疗较轻的克罗恩病，分两次口服，开始为避免过敏反应，宜从10mg/kd·d起始，在1～2周内渐加至足量。副作用包括
头痛、皮疹、恶心、呕吐、溶血以及抑制骨髓，应慎用，尤以2岁以下忌用。由于本药妨碍叶酸的吸收和利用，应每日补给叶酸。
2.外科治疗
手术指征：有急性
肠穿孔、慢性复发性
肠梗阻、
脓肿、
肠瘘形成、难治性肠出血、肛门直肠病等疾患，均须早期手术治疗，切除局部病灶，但术后复发率高。
