需要与原发性醛固酮增多症进行鉴别的疾病有以下几种：
1.原发性高血压发生低血钾 原发性高血压病服用利尿药治疗未曾补钾时可出现低血钾、肌无力，鉴别时需停服利尿药并补钾后，原发性高血压者血钾恢复正常。
2.肾缺血性高血压继发醛固酮增多 肾缺血性高血压较原醛时高，高血压的进展较快，有时在腹部可听到血管杂音。静脉肾盂造影，可见患侧肾显影和消失均延迟。血浆肾素活性增高，是产生继发性醛固酮增多的原因。体内钠丢失，过多(出汗、腹泻、肾小管酸中毒等)血容量减少时均可发生生理性肾素-醛固酮分泌增多，亦可发生继发性醛固酮增多症。
3.恶性高血压 血压极高，发展快，因毛细血管痉挛，肾脏普遍缺血，使肾素-血管紧张素分泌增高并继发醛固酮增高。高血压常伴有视网膜病，视网膜有渗出、大量出血及视盘水肿，视力障碍，同时伴有肾功能减退、氮质血症、血尿素氮增高，一般无碱中毒，血钠亦不高。
4.肾潴钠过多综合征即Liddles综合征 有家族性，肾小管保留钠的能力特别强，钠钾交换过于旺盛，钾消耗过多，出现高血压、低血钾、高血钠、碱中毒及尿排钾量增高。醛固酮分泌不增多反而减低，给予低钠饮食，螺内酯(安体舒通)都不能降低血钠，地塞米松亦无效，可用氨苯蝶啶(triamterene)治疗，直接抑制远球肾小管钠的回吸收，并减少钾的排泄，同时补充氯化钾，可使血压正常，纠正低血钾，改善临床症状。
5.先天性肾上腺皮质增生
(1)11-羟化酶缺乏：先天性11-羟化酶缺乏时，11-去氧皮质酮和11-去氧皮质醇的增多。二者皆有潴钠排钾作用，可引起高血压，同时还可有性征异常。
(2)17-羟化酶缺乏：17-羟化酶缺乏时，皮质酮及11-去氧皮质酮合成增多引起高血压、血钠增高，血钾降低，性发育障碍，男性外生殖器表现为女性。
6.肾小球旁器增生症(即Bartter综合征) 临床表现为严重的低血钾、碱中毒，血钠、氯均低，以及多饮、多尿、脱水、便秘。婴儿期可有呕吐、生长障碍，但血压正常。血中肾素-血管紧张素活性增高，醛固酮浓度亦增高，同时有前列腺素的分泌增多。病理所见有肾小球旁器增生及肾上腺皮质球状带增生。血中电解质紊乱和激素分泌增多之间的因果关系尚不清楚。治疗中曾用醛固酮拮抗剂和肾素抑制剂(甲基多巴)效果短暂;用前列腺素抑制剂如吲哚美辛(消炎痛)、阿司匹林，可使症状消退，电解质紊乱恢复正常。有人认为，肾脏产生前列腺素过多是致病原因之一。
