手术摘除是治疗眼外肌猪囊尾蚴病的惟一方法，但应注意如下几点：
1.急性炎症期
首先应抗炎治疗，全身应用大剂量抗生素和皮质类固醇，待炎症消退后方可手术。
2.手术摘除
（1）若囊虫炎性肿块较小，与眼肌粘连不明显，可仔细分离，完整摘除囊虫和囊壁。术中尽量保留部分肌束，因眼外肌储备能力极大，即使切除部分肌束也不至于影响眼球运动。
（2）若囊虫炎性肿块较大，与相邻眼外肌或眶内组织粘连融合，在摘除囊虫及肿块的同时无法保留部分眼外肌束，可将粘连融合的眼外肌及其肿块一并切除，但分离与巩膜粘连时应细心，不要穿破眼球。
（3）受累眼外肌连同囊虫肿块完全切除后，可用相邻2条直肌做部分肌束转位术，以替代受累眼外肌的功能。
3.介入性手术治疗
在超声波引导下介入性手术是近年开展的新的治疗方法。方法是超声显示囊液及头节，然后用穿刺针进入穿吸，将头节和囊液吸出，盐水冲洗。如只吸出液体而未见头节，则原位注入酒精，保留10分钟，而后用盐水置换。本法适用于所有眶内囊虫，损伤小，且行之有效。
