因有许多1岁以内发生的内斜视与婴幼儿型内斜视相似，造成诊断的困难，由于这些内斜视与婴幼儿型内斜视在治疗上有所不同，因此在临床上应予以鉴别。
1.假性内斜视
2.Duane眼球后退综合征 本征是一种先天性眼球运动障碍性疾病，其特征为眼球外转受限，内转正常或轻度受限，企图内转时眼球后退、睑裂缩小，多为单侧性。内斜度不超过30△，多数患儿有代偿头位，面转向受累眼一侧。
3.眼震阻滞综合征。
4.先天性性展神经麻痹 原眼位呈内斜视，如为一侧受累，则有代偿头位，面转向麻痹眼侧，以保持双眼单视。用遮盖法可以鉴别：婴幼儿型内斜视患者如遮盖注视眼数小时或数天后，则未遮盖眼可外转，而真性外直肌麻痹的眼外转不能。也可用娃娃头转动试验鉴别，真性外直肌麻痹的眼外转受限。
5.婴幼儿调节性内斜视 发生在6个月～7岁，平均年龄2.5岁。屈光状态多为中度以上远视。初为间歇性，戴镜后好转。斜视度多小于30△。
6.知觉性内斜视 发生于婴幼儿期的内斜视多伴有眼内肿瘤、先天性白内障、脉络膜缺损，单眼高度远视等，一眼视力下降，严重阻碍双眼视觉的发育，可导致内斜视。
