造成子宫异常发育的原因有多种，准确病因尚不明确。子宫发育异常主要是因遗传因素如基因、染色体异常，或使用性激素类药物等，导致形成子宫段副中肾管发育停止或融合不全，从而形成各种类型的畸形发育。
子宫发育异常与易感基因和阳性家族史染色体的存在有密切关系。
某些基因突变会导致子宫发育异常。
与反复妊娠、低出生体重、早产、妊娠期高血压疾病、不良表现和剖宫产密切相关。
擅自服用性激素类药物。
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