内镜检查：该检查是将带有摄像头的软管，沿着患者咽喉深入食管，以达到观察患者食管具体情况的目的。医生可通过观察病变组织的色泽、形态、长度，初步判断患者病情。正常的食道一般呈苍白色且表面光滑。而Barrett食管病变的食道看起来是红色且柔软的。
医生可通过内镜检查采集少量病变组织的样本，用色素进行染色，在显微镜下观察细胞形态，判断是否出现柱状上皮细胞，以进行确诊。同时可观察出是否伴有异型增生，以及其严重程度。轻度异型增生结构正常，可以观察到萎缩的杯状细胞。重度异型增生其结构会发生改变，可出现绒毛状分支伸向黏膜表面。
