治疗原则以药物与手术相结合的综合治疗为主，具体治疗方案主要根据鼻窦炎的严重程度来定。
轻度的慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者，先使用糖皮质激素喷剂鼻腔局部治疗3个月，如果症状体征有改善，继续使用局部激素6个月；如果无明显改善，一方面可以考虑手术，另一方面可以激素加量，如果药物治疗依然无效则行手术治疗。
中度患者使用鼻喷激素加量治疗3个月后如有效，可继续使用局部激素6个月，无效则行手术。
重度患者使用局部激素加短期口服激素，治疗1个月如果有效可继续使用鼻喷激素局部进一步治疗3～6个月，无效则考虑手术。
慢性鼻窦炎伴鼻息肉有急性感染时，可以根据细菌培养和药敏结果选择敏感的抗菌药物治疗，疗程不超过2周。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
初发较小息肉和鼻息肉围手术期者需药物治疗，主要是糖皮质激素治疗。
对初发较小息肉、鼻息肉围手术期或伴有明显变态反应表现（如打喷嚏、流清涕和鼻痒等症状）者，可应用鼻喷糖皮质激素，通常每日1次，清晨用药，严重者每日2次，需持续用药2～3个月。
伴有明显变态反应症状、阿司匹林耐受不良或哮喘的鼻息肉患者，可于围手术期口服泼尼松，具体剂量需遵医嘱。
用药期间应注意保护胃黏膜；有高血压、糖尿病、青光眼疾病患者禁用。
可稀化鼻腔鼻窦分泌物并改善纤毛活性，有促进黏液排出和有助于鼻腔鼻窦生理功能恢复的作用。
对伴有过敏性鼻炎和（或）哮喘的患者可应用抗过敏药物，包括口服或鼻用抗组胺药、口服白三烯受体拮抗剂，疗程不少于4周。
对于伴有哮喘的患者，首选口服白三烯受体拮抗剂。
多数鼻息肉，特别是多发和复发性鼻息肉者，需接受鼻内镜手术治疗。手术是针对症状的治疗，并非针对病因，术后有复发的可能。
手术是在鼻内镜和电视监视下，切除鼻息肉，开放鼻窦，纠正鼻中隔偏曲等鼻腔解剖学异常，尽可能保留鼻窦黏膜，重建鼻腔鼻窦通气引流，为鼻腔鼻窦黏膜炎症的良性转归创造条件。
可作为治疗慢性鼻窦炎伴鼻息肉的辅助方法，依据病情根据辩证施治的原则酌情使用。
鼻腔冲洗是鼻内镜围手术期常用的辅助治疗方法。
生物治疗：使用IgE、IL-5和IL-4受体的单克隆抗体肌肉内注射已被证实可以显著缩小鼻息肉体积，改善鼻塞、流涕等症状和生活治疗，但需针对相应的免疫特征和分型，是未来精准治疗的选择。
