1.华支睾吸虫伴慢性或急性胆囊炎 虫体本身、胆管上皮的损害，容易引起胆道梗阻及细菌感染。在广东珠江三角洲流行区内因胆道疾患住院治疗者合并华支睾吸虫感染率达75%。临床表现为腹痛、胆囊肿大、寒战、发热，大量虫体引起梗阻性黄疸。
2.胆道结石 华支睾吸虫引起的结石多为肝内胆管多发性色素结石，这与虫体多寄生在中小胆管有关。国内一组报告2214例华支睾吸虫病例中，93例胆结石，占4.20%，对照组结石仅0.31%。
3.胆管炎性狭窄 肝吸虫寄生的胆管发生腺瘤样或息肉状增生，反复发作的胆管炎，胆管壁纤维增厚，导致胆管狭窄梗阻，这种狭窄多见于中等大小的肝内胆管。在对吸虫引起的胆道梗阻行ERCP检查时，发现乳头插管均遇到不同程度的困难，良性乳头括约肌狭窄57.2%(8/14例)，说明吸虫可以引起胆道远端狭窄。
4.胆管癌 华支睾吸虫感染后胆管癌发生率明显高于无感染者，其特点是：①肿瘤包绕的胆管内或与肿瘤相连的胆管内，常可发现华支睾吸虫成虫或虫卵;②组织学检查见胆管周围纤维化，胆管上皮黏液分泌增多，呈腺瘤样增生。一组45例确诊感染者，发现5例胆管癌，1例十二指肠乳头癌。在香港胆管癌的发生也与吸虫感染有密切关系。
5.胰腺炎 成虫阻塞胰管引起。
