医生会对患者进行相应的体格检查，再进一步通过内镜、影像学检查明确病因。一般情况下，胃镜检查发现黏膜的异常表现，即能确诊。具备以下1、2项可作疑似诊断，同时具备3、4项可确诊。
有上腹痛、反酸、嗳气、食欲不佳、黑便等类似十二指肠溃疡的症状。
十二指肠激惹、痉挛、变形，肠黏膜增粗紊乱，但无特征性龛影。
镜下可见十二指肠黏膜充血、水肿、糜烂、渗出，伴有炎性分泌物、出血，可发现显露的血管。黏膜粗糙、皱襞粗大呈颗粒状、息肉样改变。十二指肠壶腹部变形，但无溃疡表现。
取十二指肠黏膜活检，可见绒毛上皮变形，扁平萎缩，固有膜内大量炎性细胞浸润，胃上皮化生等。
十二指肠炎主要表现为腹部不适和消化不良的症状，与慢性胃炎、胃泌素瘤、肠结核等消化道疾病症状有部分相似，因此需要注意鉴别。
临床表现为有慢性、长期的上腹部不适或疼痛、腹胀，餐后饱胀或出现早饱感，与十二指肠炎症状相似，但胃镜检查发现胃黏膜萎缩或充血渗出，而无明显十二指肠黏膜病变，以此可鉴别。
临床表现为上腹部烧灼样疼痛，有不同程度的腹泻，且对正规溃疡病治疗反应欠佳。而十二指肠炎经过正规溃疡病治疗后，一般症状可改善。通过B超、CT等影像学检查，也有利于鉴别诊断。
主要体现为右下腹或脐周的慢性腹痛、腹泻、原因不明腹部包块等表现，就餐后相对较重，可伴有腹鸣现象，排便或排气后症状可减轻，同时患者还会出现午后低热、盗汗、乏力、消瘦等全身表现，而十二指肠炎主要为消化不良的表现。本病可通过X线胸片、CT检查、腹腔镜等进行鉴别。
