胆总管结石是最常见的消化系统疾病之一，包括原发于胆总管的结石和由胆囊或肝内胆管排出后进入并停留于胆总管内的结石。
原发性胆总管结石在亚洲地区较为常见，尤其是在台湾、香港、新加坡以及东南亚国家中肝内胆管结石的发病率非常高。在台湾，胆结石病中肝内胆管结石的比例超过50%，而其中70%的病例合并发生胆总管结石。
继发性胆总管结石在西方国家和日本比较常见。约15%的美国人患有胆结石病，每年有超过70万人行胆囊切除术，这其中有10%~15%的胆囊结石患者合并有胆总管结石。
在日本，约有10%的人有胆结石病，其中胆总管结石患者逐渐增加至胆结石患者的20%。
胆总管结石根据其来源，可分为原发性结石和继发性结石。
大多为棕色胆色素结石或混合性结石，其诱发病因较多，主要包括胆道感染、胆道梗阻、胆汁淤积、胆道力学改变、乙型肝炎病毒、寄生虫，以及缝线线结等。
大多为胆囊结石或肝内胆管结石排进胆管并停留在胆总管内，为黑色胆色素结石或胆固醇结石。
