需要根据疖肿的不同阶段采取不同的治疗，早期多采取局部治疗。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
药物主要用于治疗炎症和控制感染。
外耳道疖肿局部治疗很重要，根据疖肿不同阶段，采取不同治疗措施。
可以用鱼石脂甘油或鱼石脂膏敷于患处，也可以局部热敷、微波治疗。
未成熟的疖禁忌打开，防止炎症扩散；如果顶部有白色脓栓，可轻轻刺破脓头，轻柔将脓头压出。
如疖较大有明显的波动，或者已经化脓破溃的疖肿可局麻下切开引流，脓腔置引流条。脓肿引流后，用3%双氧水和无菌生理盐水反复冲洗脓腔，确保所有脓液都已清除。
术后可以应用抗生素，如双氯西林和头孢氨苄等。如果怀疑耐甲氧西林金葡菌感染，可以应用甲氧苄啶、磺胺甲恶唑、克林霉素或强力霉素等。
首选耐酶青霉素，头孢类，大环内酯类或喹诺酮类抗生素。如果外耳道疖肿严重到需要住院治疗，一定是先做脓培养和药敏试验，选用敏感的抗生素。使用时应同时考虑到抗生素的不良反应及毒副作用。
可使用含有葡萄糖酸氯己定和异丙醇，或2%~3%的氯二甲酚的液体肥皂清洁，并给予抗生素治疗以预防。
积极治疗易感因素，如肥胖、糖尿病、职业性或工业性接触等诱发因素。
对于已化脓破溃的疖肿，则应及时切开引流，切忌挤捏和早期切开。
在外耳道疖肿发病早期，可以应用微波或激光治疗。通过微波和激光，改善局部血液循环，促进病灶炎性物质的排出，并起到一定的镇痛作用。
