应及时进行治疗，避免病变进一步加重。治疗以针对病原虫的药物治疗为主，一般治疗和手术治疗辅助支持，推荐药物有吡喹酮、三氯苯达唑。
应及时输液，保证水电解质平衡；加强营养，必要时可以输注葡萄糖或营养液，改善患者体质。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
患者可在医生指导下使用以下药物进行治疗。
吡喹酮是目前的首选药物，抗虫效果好，具有不良反应少而轻、疗程短、方便等优点。脑型患者需要增加疗程，2~3天为一个疗程。少数患者有神经肌肉、消化系统不良反应、心律失常等，应给予重视。部分患者可以采用脱敏疗法避免过敏反应。
三氯苯达唑对肺吸虫杀灭作用明显，疗效与吡喹酮类似，患者耐受性优于吡喹酮，口服基本就可以完全治愈，妊娠妇女也可服用。服用后可能出现轻微的头痛、头晕、腹痛等不良反应，毒性低。
硫氯酚治愈率尚可，但疗程长，目前已很少用。对脑脊髓型患者疗效差，腹泻、恶心、呕吐等不良胃肠道反应明显，严重者有呼吸急促、发绀、喉头水肿、缺氧等表现，妊娠期妇女慎用。如果出现过敏性休克，应立即停药，同时用肾上腺皮质激素治疗。
对于有发热、咳嗽、胸痛者酌情给予解热阵痛、镇咳药物；颅内高压者使用甘露醇等脱水剂；癫痫发作时可服用苯妥英钠或安定等。
手术对本病的治疗意义较小，主要用于严重症状的针对性治疗。
该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物可缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
