鼠疫是细菌引起的烈性甲类传染病，严格隔离患者和疑似患者。对患者采取抗菌治疗和对症支持治疗。鼠疫的治疗仍以链霉素（SM）为首选，注意早期、足量、总量控制的用药策略。
用量根据病型不同、疫源地不同而异，肺鼠疫和败血型鼠疫用药量大，腺鼠疫及其他各型鼠疫用药量较小。
患者应卧床休息，给予患者流质饮食，或葡萄糖和生理盐水静脉滴注，维持水、电解质平衡。
密切观察病情变化和生命体征，对出现呼吸道症状者，每天定时或持续监测脉搏血氧饱和度（SpO2），定期复查血常规、尿常规、血电解质、肝肾功能、心肌酶谱、痰培养、血培养（第一次标本应当在抗菌药物使用前留取）和X线胸片，有条件者行动脉血气分析、肺部CT检查等。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
发热大于38.5℃，或全身酸痛明显者，可使用解热镇痛药。高热者给予冰敷、酒精擦浴等物理降温措施。儿童禁用水杨酸类解热镇痛药。有心力衰竭或休克者，及时强心和抗休克治疗。
有弥漫性血管内凝血（
腺鼠疫肿大的淋巴结切忌挤压，皮肤病灶可予0.5%~1%的链霉素软膏涂抹，必要时可在肿大淋巴结周围注射链霉素并施以湿敷，病灶化脓软化后可切开引流。
链霉素成人首次1g，以后0.5~0.75g，每4~6小时肌注（2~4g/d）。体温下降至37.5℃以下，全身症状和局部症状好转时逐渐减量。患者体温恢复正常后按常规用量继续用药3~5天。疗程一般为10~20天，链霉素使用总量一般不超过60g。
链霉素成人首次2g，以后1g，每4~6小时肌注（4~6g/d）。全身症状和呼吸道症状显著好转后逐渐减量。疗程一般为10~20天，链霉素使用总量一般不超过90g。儿童根据具体病情确定给药剂量，参考剂量为30mg/（kg?d），每12小时1次。减量时要特别注意不要大幅度减量，防止病情反复 。
按一般外科疗法处置皮肤溃疡，必要时局部滴注链霉素或敷磺胺软膏。
在特效治疗的同时，辅以氯霉素治疗，成人50mg/（kg?d），每6小时1次，静脉滴注，疗程10天，儿童根据具体病情确定给药剂量。亦可选用氨基糖苷类、氟喹诺酮类、第三代头孢菌素及四环素等。
参考腺鼠疫治疗方法。
主要包括庆大霉素、卡那霉素、阿米卡星等，可在链霉素过敏或妊娠情况下使用，具体用量可参见中国卫生健康委员会应急办公室发文。另可使用喹诺酮类、四环素类药物进行联合治疗。
该类药物抗菌谱广、抗菌活性强，属于浓度依赖性抗生素，目前主要用于联合用药。肺鼠疫和鼠疫败血症患者可采取氟喹诺酮类（环丙沙星、氧氟沙星、左氧氟沙星）的一种作为联合用药。
环丙沙星：成人400~600mg/d，静脉滴注，或500mg/d，口服，每12小时一次，疗程10天。其他氟喹诺酮类可参照药物说明书使用。
对临床各型鼠疫患者可采取四环素作为联合用药。四环素：成人：2g/d，每6小时一次，口服；儿童(9岁以上)：25~50 mg/（kg?d），每6小时一次，口服。
该疾病一般无需手术治疗。
该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物可缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
对于重症患者，给予常规抗休克治疗、呼吸支持治疗、纠正弥漫性血管内凝血（DIC）、维护其他重要脏器功能等治疗。
