肺部听诊可闻及细湿啰音，极少数患者并发胸腔积液时，肺部听诊时呼吸音降低，叩诊呈浊音或实音。
大多无明显异常，部分患者淋巴细胞比例可增高，红细胞沉降率可轻度增加，轻到中度贫血。艾滋病患者白细胞计数降低，并可出现不同程度的贫血。
免疫功能异常的患者主要表现为间质和肺泡的渗出和实变，如局限小斑片阴影或呈节段、叶性分布的大片状肺实质浸润。
免疫功能正常的患者多表现为孤立或多发结节影，病灶多界限分明，无钙化或空洞，内部可见“支气管征”，肺实变、胸腔积液和淋巴结肿大较少见。
若病原体通过血行播散，双肺呈弥漫性改变，肺实质呈粟粒状小结节状浸润阴影，也可表现为网状结节影。
可表现为结节肿块病变、浸润性病变和混合性病变，病灶可单发或多发，以右肺、下叶为主，好发于肺野外带，通常邻近或累及胸膜。“晕轮征”和“近端支气管充气征”为本病的特征性影像学表现。
是指在超声或CT引导下经支气管镜活检、经皮肺穿刺活检及电视胸腔镜辅助肺活检等方式获取组织标本，经特殊染色发现隐球菌即可确诊，是诊断本病的金标准。
目前临床常用的一种简便、快速、敏感度和特异度高的检测方法，是隐球菌早期诊断的主要手段，常采用乳胶凝集试验法对血清、肺泡灌洗液、胸水进行检测。
