目前骨样骨瘤的治疗主要依靠手术治疗，辅以药物治疗等。
骨样骨瘤的一般治疗主要包括疼痛治疗和功能锻炼。
应用非药物方法来缓解患者疼痛，如放松训练、催眠、暗示、想象等。术后抬高患肢预防肿胀导致的疼痛。
骨样骨瘤一般对功能影响较小，术后可早期开始，循序渐进地进行患肢功能锻炼。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
药物治疗在骨样骨瘤的治疗中，主要目的是缓解疼痛，常作为治疗的辅助手段。对于特殊情况无法手术的患者，可以考虑药物治疗缓解症状。药物治疗主要包括非甾体类镇痛抗炎药（NSAIDs）。
目前研究认为骨样骨瘤导致的疼痛主要与前列腺素有关，NSAIDs类药物可以缓解症状，但对于疾病的治疗没有帮助。NSAIDs可影响胃黏膜屏障，因此有消化性溃疡或怀疑溃疡者应慎用。
开放手术即在麻醉下将瘤巢全部切除，必要时可扩大手术范围防止复发。为提高骨稳定性可在原肿瘤位置移植自体骨或其他骨填充材料，并加以钢板固定，钢板待骨生长完全后可取出。
相比于传统开放手术，CT引导下手术能更精确定位瘤巢位置，手术切口和创伤减小，病灶清除率更高，术后恢复更快。
对于特殊部位的骨样骨瘤患者，可在关节镜下行病灶挖除术，如髋关节、足部关节等，关节镜治疗较传统手术损伤小、恢复快。
RFA应用经皮电极通过CT引导穿入瘤巢部位，射频热量消除肿瘤。此手术精确性及微创性高，损伤小、恢复快，尤其适用于年轻的患者。但仍有不足，如费用较高、热量有破坏周围正常组织可能、复发率较传统手术高等。目前RFA治疗骨样骨瘤已经成为国内外常用的骨样骨瘤治疗手段，综合治疗效果不劣于传统手术方式。
骨样骨瘤的新兴手术方式随技术发展不断涌现，进一步推动骨样骨瘤治疗方式上的改革，目前的前沿治疗主要包括：
CT引导下精确定位瘤巢位置，冷冻针靠近或穿入瘤巢，通过冷冻-消冻-冷冻循环来破坏肿瘤。较RFA损伤更小，且术中有生理盐水保护正常组织，患者术中痛苦较小。但该技术应用于骨样骨瘤的治疗时间尚短，远期复发率如何尚有待进一步随访。
为新兴技术。是一种无侵入性的、不受辐射伤害的治疗方法，尤其对儿童等正在生长发育的患者有明显优势。其主要通过将超声波聚集到一根针上并在目标区域提供热量来消融病变组织。MRI可实时控制热量大小及分布，能够在术中直接确认瘤巢消融与否。但该技术应用于骨样骨瘤的治疗时间尚短，远期复发率如何尚不明确。
