化脓性甲沟炎的主要病因是由于甲周组织发生微小创伤后继发细菌感染。
常由于局部外伤、过度修甲、撕咬倒刺等微小创伤，破坏了甲周的正常皮肤屏障，引起细菌（主要是金黄色葡萄球菌）侵入，从而导致局部感染化脓。
指（趾）甲嵌入甲沟软组织内，导致甲沟部软组织受到挤压，影响局部血液循环产生炎症感染，是引起化脓性甲沟炎的主要原因。嵌甲可能与不良生活习惯有关。如鞋子较小、鞋头狭窄等有关。
可能与不良卫生习惯有关，如有拔手指甲肉刺、咬指甲等。甲沟部污物积聚，细菌繁殖产生炎性症状。
跌伤、踢伤或剪甲等造成甲沟或甲床组织损伤，继发细菌感染。
