手术是治疗脊髓脊膜膨出的主要方法，但对于手术时机的选择，既往文献报道不一。有学者认为最好在1～1.5岁后手术，理由是：(1)年龄较大时，膨出囊基底部皮肤较厚，较少发生术后伤口愈合不良的并发症；(2)年龄较大时排便有规律，术后大小便污染伤口的机会减少；(3)在此期间可以观察脑积水、神经功能障碍等的发生、发展情况；(4)年龄较大时对手术的耐受力较好。而也有学者认为应尽早实施手术，病程越短效果越好，理由包括：(1)早期脊柱裂孔小，突出物不大，手术操作简便、时间短、创伤小；(2)早期手术阻止了病情发展，避免由于脊柱比脊髓生长相对迅速而造成脊髓栓系综合症(tetherad cord syndrom，TCS)；(3)早期脊髓、马尾神经的膨出比例较低，膨出神经与囊壁的粘连轻，有利于手术分离；(4)脊髓脊膜膨出患儿下肢活动障碍，缺乏有效锻炼，椎旁肌肉、筋膜发育不良致使脊髓脊膜膨出症状加重，而早期手术后患儿能正常活动，有利于组织修复和减少术后复发。