医生对患者的患眼进行观察。检查时患者需要睁大眼睛，确保医生能通过仪器看到患眼的情况。如果症状典型，医生会看到睫状体充血、角膜浸润及溃疡形成。
检查时，医生会在患者眼睛溃疡部位刮取一些组织标本，将其送至实验室进行成分分析。这个过程会让人感到紧张和害怕，不过并不痛苦。
将刮取到的组织进行病理染色，可在早期辅助病因学诊断，也可同时进行细菌、真菌、棘阿米巴培养，为选择敏感的抗菌药物提供可靠的依据。
病变发展到角膜深层或经药物治疗后，刮片镜检的病原体阳性率降低，可进行角膜病变区组织活检以明确病因。
此项检查对感染性角膜炎如棘阿米巴角膜炎和真菌性角膜炎的早期诊断有较高的价值。
裂隙灯是一种专业的眼科检查仪器，可以提供明亮的光源和放大倍数，以检测角膜炎的特征和程度，同时可辅助眼科医生对眼睑、结膜、巩膜、虹膜、晶状体进行全面的检查。
怀疑免疫性角膜炎者需要进行相应的免疫学检查。
