- 银屑病可引起指甲上出现不规则点状凹陷，即“顶针状”改变；
- 扁平苔藓可引起特征性的甲纵形碎裂、残缺、萎缩及翼状胬肉样改变；
- 手足部湿疹若累及甲部也常致甲板灰暗，表面不平，但其常合并甲周皮炎伴瘙痒等症状；
- 雷诺氏现象的疾病，有甲变色、变薄或萎缩，可能出现反甲、纵嵴或沟纹、甲下钙盐沉积等改变，但其一定是伴有肢端典型的雷诺氏征；
- 斑秃甲损伤可表现为甲板粗糙混浊无光泽、甲水滴状下凹、纵嵴和不规则增厚、变脆易碎，甲板与甲床分离等，但通过其典型秃发表现与甲癣容易鉴别；
- 甲真菌病还需与先天性白甲症、甲母痣、先天性厚甲症、甲母质瘤、Bowen病、甲下黑色素瘤等疾病的甲改变相鉴别，这些皮肤病引起的甲改变与甲真菌病鉴别主要依靠临床特征、真菌学检查和组织病理检查。
