首先，医生检查患者的口咽，查看扁桃体的情况。
扁桃体肿大分为三度：Ⅰ度扁桃体超出腭舌弓但不超过腭咽弓；Ⅱ度扁桃体肿大超过腭咽弓；Ⅲ度扁桃体肿大达到咽后壁的中线。
此外医生还会检查患者耳、鼻这些可能被感染的部位，另外还会检查患者的颈部和下颌是否有淋巴结肿大。
细菌感染的患者常伴有外周血白细胞计数增高、中性粒细胞百分比增高、红细胞沉降率增高和Ｃ反应蛋白增高。
可查到致病菌以指导临床用药。
当怀疑有并发症出现时，可选择相应的检查。例如，考虑有肾脏并发症时，应进行尿和肾功能等相关检查。少数（传染性）单核细胞增多症导致的扁桃体发炎，还会进行相应的病毒学检查。
