患者可有发热和上呼吸道炎症等症状，但麻疹患者的口腔及颊黏膜可以出现特征性症状即麻疹斑，并伴有眼结膜炎症状，可与急性咽炎鉴别。
多见于儿童，由A组β型溶血性链球菌引起。早期可以出现寒战、高热，与急性咽炎症状有些类似。但猩红热患者会出现典型的全身弥漫性鲜红色皮疹，疹后恢复期有明显脱屑症状。经咽拭子分泌物可培养出溶血性链球菌。
是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病，可有鼻腔黏膜充血，伴有全身酸痛、乏力及头痛等症状。患者高热等中毒症状明显，而鼻咽部症状较轻，与急性咽炎有所不同。
患者出现发热、咽痛症状，有时伴有皮疹、肝肿大。与急性咽炎不同是，患者咽痛轻，扁桃体肿大，表面可以看见灰白色分泌物附着，容易拭去。
患者可有咽痛、发热等症状，与急性咽炎类似。但粒细胞减少性咽峡炎患者咽痛程度不一，全身症状重，且扁桃体以及周围组织存在坏死性溃疡。
患者有乏力等全身表现，通过骨髓涂片可以明确诊断，通过血液常规检查可以与急性咽炎相鉴别。
患者可表现有单侧牙齿疼痛或一侧咽痛。与急性咽炎不同的是，心肌梗死患者主要是出现心绞痛，常烦躁不安、出汗，伴有发热等全身症状。
患者可有咽部不适等症状，初期多误诊为咽炎，但甲状腺疾病患者存在特征性的甲状腺局部表现（如甲状腺肿大），且可通过颈部B超进行鉴别。
是梭形杆菌及樊尚螺旋体感染引起的溃疡性炎症，患者可表现为咽痛和全身症状，易与急性咽炎混淆。但樊尚式咽峡炎患者常只有单侧咽痛，扁桃体上覆有灰色或黄色的假膜，易于拭去，擦去后可见下面有溃疡。血常规白细胞计数略有升高，咽拭子涂片可见致病菌。
