目前尚缺乏特效治疗，应强调一般及支持疗法。
(1)一般情况下，可试用利巴韦林或干扰素。
(2)新生儿心肌炎的进展迅速，应给氧及保持安静，出现心力衰竭时及早采用快速洋地黄疗法。
(3)有惊厥及严重肌痛者给予镇静剂或普鲁卡因局部封闭，麻醉剂如吗啡、哌替啶等不宜轻易采用。
(4)给予适当的抗菌药物以防止继发细菌感染。
(5)如果有心肌炎伴心力衰竭、心源性休克、严重心律失常(如高度房室传导阻滞、病态窦房结综合征等)、心包炎患者，则可以考虑肾上腺皮质激素。值得注意的是，鉴于此激素可抑制机体免疫功能，有利于病毒的复制，因此一般病例不宜采用。
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