患病后需消除诱发因素，医生还会根据疾病的严重程度给予局部或全身抗真菌药物，病情严重或反复发作者需要延长治疗时间，真菌学检查阴性后，还需巩固治疗。
性伴侣一般无需接受常规治疗，但有龟头炎症者，需要进行相关检查及治疗。男性伴侣包皮过长者，需要每天清洗，建议择期手术。
及时停用广谱抗生素、雌激素等药物，积极治疗糖尿病。
患者应勤换内裤，停止穿紧身化纤内裤，用过的毛巾等生活用品用热水烫洗。
使用碱性溶液擦洗阴道或坐浴，不推荐阴道内冲洗。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
患者可在医生指导下选用局部用药或全身用药的方式进行治疗。
单纯性霉菌性阴道炎治疗比较简单，局部用药包括克霉唑栓剂、咪康唑栓剂或制菌霉素栓剂等，全身用药常用氟康唑；对于复杂性霉菌性阴道炎，用药复杂、疗程较长，医生会根据真菌培养和药敏试验结果选择合适的药物。
局部用药可选用克霉唑栓剂、咪康唑栓剂或制菌霉素栓剂放置于阴道深部。
未婚女性、不能耐受局部用药者及不愿采用局部用药者可选用口服药物，常使用氟康唑，顿服。
无论是局部还是口服用药，疗程均需要延长。局部用药可延长至7～14天；症状严重者，外阴局部可应用低浓度糖皮质激素软膏或唑类霜剂。
医生会根据真菌培养和药敏试验结果选择合适的药物，分为强化治疗及巩固治疗，强化治疗阴道用药可选用咪康唑栓或软胶囊、克霉唑栓或片，口服用药可选用氟康唑。真菌学检查阴性后进行巩固治疗，每月发作规律者，可在每次发作前预防用药1次，连续6个月；没有规律的发作者，可采用每周用药1次，连续6个月。长期应用抗真菌药物者，应检测肝、肾功能。
选择对胎儿无害的局部唑类药物，7日疗法效果较好，禁止口服唑类药物。
辨证论治。
湿虫滋生证：治以清热利湿，杀虫止痒，方用萆薢渗湿汤加减。
湿毒内蕴证：治以利湿解毒，杀虫止痒，方用止带方加减。
肾虚湿阻证：治以温肾燥湿，固束带脉，方用温肾除霉汤。
用清热利湿、杀虫止痒的中药煎汤外洗。
微波治疗可以改善局部血液循环，通过温热的良性刺激，局部营养和代谢明显改善，促进病理产物的吸收和消散，促进组织的再生和修复；而且可以加强未损伤血管的代偿作用，改善组织缺氧状态，有利于炎症的吸收，可以迅速消除炎症。
