现如今常用的有三种方法：B超检查、IVU检查、膀胱镜检查，其中B超检查是初诊和筛选的首选方法，可以准确观察到输尿管囊肿在膀胱内的确切位置、大小和形态，于膀胱三角区的侧方可以看见典型的圆形含液性光环，随输尿管蠕动呈明显的周期性增大和缩小。IVU检查是最基本的检查方法，可以观察到肾脏、输尿管、膀胱情况，了解泌尿系有无畸形、功能障碍，输尿管囊肿内充盈造影剂时呈典型的“眼镜蛇”样特征性表现，排尿期膀胱造影更是观察有无输尿管返流的主要方法。膀胱镜检查可以直接观察到膀胱内情况，但是由于个别输尿管囊肿可以随膀胱内压增加而变小，甚至可以完全消失，所以，在用膀胱镜观察时一定要注意进水的多少，避免膀胱内压力过高而致囊肿消失，造成漏诊。