外阴疣状癌的首选治疗方法为手术切除，由于外阴疣状癌转移情况较少，并且存在侵犯骨质情况，所以治疗上应进行广泛深切，还可配合冷冻、电烧灼及二氧化碳激光等物理治疗。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
合并感染者，可对症给予药物治疗。局部外用细胞毒性药物也有一定的疗效，但是具体效果还有待观察，不作为治疗首选。
外阴疣状癌患者禁忌放疗，因为放疗无效，甚至可引起间变性转化，导致发生局部和远处转移，甚至促使复发。
外阴疣状癌进行化疗无效，甚至有研究认为可以促进肿瘤生长。
手术是外阴疣状癌的首选治疗方法，由于疣状癌易局部复发，所以要行较广泛的局部切除术，切除基底部要足够深，注意切除肿瘤边缘。如果区域淋巴结有转移，则做根治性外阴切除术和两侧腹股沟淋巴结清除术，以防止疣状癌进一步转移扩散。
可使肿瘤及病损消除，而且有快速止血的作用。
利用电高温使肿物或组织碳化，并予以切除的疗法。
常用液氮破坏癌细胞结构并帮助肿物消退，可减少出血和疼痛，但冷冻不涉及组织的切除。
