血液中的白细胞数、中性粒细胞百分比以及红细胞沉降率等有助于辅助诊断心肌炎。
心肌酶（包括磷酸肌酸激酶同工酶、磷酸肌酸激酶、乳酸脱氢酶和谷草转氨酶）早期多有升高，其数值在小儿心肌炎早期诊断有提示意义。
心肌肌钙蛋白的变化对心肌炎诊断的特异性更强，但敏感度不高。
心脏负荷过重和心力衰竭的敏感指标。
病毒感染性心肌炎在早期可从患儿心包积液、咽拭子或大便中分离出特异病毒，可以通过病毒血清学检查早期诊断。
心内膜心肌活检（EMB）：指用特殊仪器取出心肌组织的微小样本，以检查炎症或感染。目前认为该检查是诊断心肌炎金标准，但因取样部位的局限性、患儿的依从性不高以及该检查的有创性，故应用有限。
通过心电图检测可见以R波为主的2个或2个以上主要导联的ST-T改变持续4天以上伴动态变化，窦房传导阻滞、房室传导阻滞，束支传导阻滞，室性早搏，房性早搏，室性心动过速，房性心动过速，低电压等。
X线影像可以显示心脏的大小和形状，以及心脏内部或周围是否有液体，可提示心力衰竭。
心脏MRI可以显示心脏的大小、形状和结构。该检查可显示心肌炎症的迹象。
超声波可以显示心脏跳动的运动图像。超声心动图可以检测到心脏扩大，泵送功能不佳，瓣膜问题，以及心脏内的血凝块或心脏周围的液体。
67Ga心肌显像阳性提示心肌炎。111In单克隆抗肌凝蛋白抗体心肌显像可检测心肌坏死，有助于心肌炎诊断。
